哈尔滨学院的直接策划者后藤新平是日本侵华战略中的重要人物。1906年11月担任满铁首任总裁。在他的亲自协调下，日本政府出资25万日元，满铁投资5万日元，在哈尔滨建设起了一期校舍(现位于南岗区中宣街24号)。

　　哈尔滨学院的招生对象面向日本应届高中生。招生的方法是推举加考试，1920年首届招生53名，其中日本国内37名(每县一个名额)，中国东北16名。